這個柯學世界不一般，在大多數都是凡人的社會裡，存在著一些練武和會魔法的存在，當渴望長生的黑衣組織，和欲圖重置世界的魔眼組織交叉在一起的時候，會發生怎樣的事情？
簡介:從半歲開始就生活在組織的劉新一，因為相信了赤井秀一會救宮野誌保和宮野明美脫離組織，在他跑路之後間接導致了宮野明美被琴酒命令進行一場十億元搶劫計劃
在某場晚宴上深知這是一場自殺行動而獨自買醉的劉新一，偶然遇見了一場密室殺人案
也就在此時，一位名叫工藤新一的高中生偵探偶然出現在了劉新一的視線裡麵…………
注意:本作劇情主要朝著柯南動漫走，不過略作修改，為了讓兩個世界的很多角色在本作合理，或多或少都會增加一些有趣的新設定